乌拉圭政府军中各高级将领对博达维里总统的铁腕统治仍不感到满足，于1976年6月迫使其辞去总统职务。7月，国务委员会和“将军委员会”共同推举阿帕里西奥·门德斯·曼弗莱迪尼为新的总统。门德斯继承博达维里的衣钵，上台后继续实行专制统治。但迫于国际国内形势的压力，门德斯政府于1980年开始部分政治上的松动。门德斯任满后，1981年9月由国务委员会任命的格雷戈里奥·孔拉多·阿尔瓦雷斯·阿梅利诺上将为总统，组织过渡政府，为在乌拉圭恢复立宪政体准备条件，并于1985年3月1日正式将总统绶带交给民选总统胡利奥·玛丽亚·桑吉内蒂，从而结束了为期12年的军人独裁统治。
乌拉圭1973年的政变以及以后12年的独裁政权的统治。在这期间，先后有近100万人到国外避难或流亡，大约8000人受到传讯或拷打，被长期关押的政治犯达1500人。上百人被杀害，164人“失踪”。1985年12月17日，乌拉圭共产党总书记罗德内·阿里斯门迪在党的代表会议上总结说：在军人倒行逆施的12年间，全国生产萎缩、经济混乱，大约60％的生产设备变成一堆废铁。在这期间，生活费用上涨了175倍，在号称“南美洲瑞士”的国度里，到处可见到乞丐，国家背上了60亿美元的外债，使乌拉圭人成为世界上人均负外债最高的民族之一。