除了开一炮吓瘫了辫子军，段祺瑞还派出南苑航空学校校长秦国镛开着飞机在紫禁城上空盘旋一阵，然后扔下了三颗炸弹。这三颗炸弹一颗落在御花园的水池里，一颗落在西长街隆福门的瓦檐上，还有一颗落在隆宗门外炸死了一名轿夫。
秦国镛的这次轰炸，其实就是敲山震虎，吓唬吓唬那些不知天高地厚的遗老遗少，炸弹几乎清一色奔着开阔空旷的地方去的，炸死那名轿夫也纯属意外。轰炸带来的效果显而易见，用溥仪的话说，“宫中掉下讨逆军飞机的炸弹，局面就完全变了”。遗老们赶紧委托梁鼎芬去求日本人含泽，通过他请求日本公使馆致函讨逆军，要求停止轰炸，溥仪同时宣布再次退位。
讨逆军最终取得胜利，重新控制了北京，段祺瑞在汤化龙、张国淦等人的陪同下进入北京，此时段祺瑞已经成为三造共和的英雄，是何等的意气风发。但这个时候问题就出现了，段祺瑞固然可以当回他的国务院总理，但是谁来当总统是个问题。
段祺瑞固然是不待见黎元洪的，但讨逆时期的代总统冯国璋也不对段祺瑞的胃口，黎元洪虽然让他不满意，但手中并无实权，顶多就是手下几个幕僚煽风点火罢了。但冯国璋可不一样，他是北洋系中仅次于段祺瑞的第二号人物，“两害相权取其轻”，段祺瑞思来想去，还是派江朝宗到日本公使馆去请黎元洪。但黎元洪已经无意再在段祺瑞手下做傀儡，对江朝宗表示自己既然在讨逆期间已通电辞去总统一职，就应由代总统冯国璋署理总统职权。